L’histoire du vin de Samos commence avec les Amazones et Dionysos, le dieu de l’euphorie, de la vigne et du vin. Les fières Amazones ont commis l’erreur de le mépriser et de s’enfuir vers Samos, recouverte de pins. Dionysos a demandé l’aide des Samiens pour les vaincre, et après avoir réussi, il a donné aux habitants de l’île isolée la vigne qui produit le « raisin muscat » avec les petits épis et leur a appris à le cultiver principalement sur des terrasses montagneuses.

Il existe des mentions du vin samien dans les épopées homériques, Hippocrate, Galen et Théophraste ainsi que la poésie de Lord Byron, mais aussi des mentions modernes dans des livres d’écrivains européens modernes tels que Marguerite Yoursenaard.

Au début du XVIIe siècle, le voyageur français Tournefort recensait une production de 3 000 barriques de vin de Muscat sur l’île. Depuis le 19ème siècle, on sait que Samos approvisionnait les marchés de l’Ouest et de l’Est en vins de marque. Depuis, l’Église catholique a accordé à Samos le privilège de produire du vin avec un certificat de mission catholique. Le « vin d’église » est également utilisé par l’Église orthodoxe pour la préparation de la Sainte Eucharistie.

Les vignobles patrimoniaux en forme d’amphithéâtre, jusqu’à 900 mètres d’altitude, témoignent de la longue tradition vitivinicole de l’île et assurent au raisin muscat microrogo une maturation lente et régulière, jusqu’à ce qu’il acquière des niveaux de sucres très élevés et s’enrichisse en les arômes de la végétation dense. Pour toutes ces raisons, le vin Samian possède l’une des appellations d’origine contrôlées les plus anciennes d’Europe.